塔斯馬尼亞虎成為第一種提取RNA的滅絕動物

塔斯馬尼亞虎有一個漫長而曲折的歷史現(xiàn)在，這包括成為科學(xué)家從中恢復(fù)RNA的第一個滅絕動物家族，RNA是使物種基因組栩栩如生的分子。

通過一種經(jīng)過特殊修改的方案，瑞典團(tuán)隊從132歲的塔斯馬尼亞虎或袋狼的皮膚和肌肉中提取了數(shù)百萬條RNA鏈。

被科學(xué)家稱為袋狼，條紋，肉食性有袋動物是被獵殺至滅絕1930年代在澳大利亞塔斯馬尼亞島上。

從袋狼等滅絕動物身上恢復(fù)RNA（將DNA中編碼的信息轉(zhuǎn)化為蛋白質(zhì)的遺傳物質(zhì)）可以打開有關(guān)基因活性的信息寶庫。思緒已久.

“活細(xì)胞中不再存在的RNA表達(dá)譜的恢復(fù)擴(kuò)大了深入研究滅絕動物生物學(xué)的可能性，”斯德哥爾摩大學(xué)的生物信息學(xué)家Emilio Mármol-Sánchez及其同事在他們發(fā)表的論文中寫道.

“這是我們第一次瞥見袋狼特異性調(diào)控基因的存在，例如microRNA，這些基因在一個多世紀(jì)前就滅絕了”，增加斯德哥爾摩大學(xué)的分子生物學(xué)家Marc Friedl?nder。

雖然讀取DNA序列告訴我們一個物種具有哪些基因，但RNA序列揭示了哪些基因?qū)嶋H上被“打開”并用于在細(xì)胞內(nèi)制造蛋白質(zhì)。但RNA要脆弱得多，并且會分解快得多，快得多而不是DNA，因此搶救歷史樣本具有挑戰(zhàn)性 - 但并非不可能。

Mármol-Sánchez及其同事從袋狼標(biāo)本中采集了六個肌肉和皮膚樣本，該標(biāo)本于1891年被編目并擱置在斯德哥爾摩的自然歷史博物館。

從132歲的袋狼身上回收的RNA并不是最古老的，而且相去甚遠(yuǎn)。近年來，RNA已被從狗狀犬科動物在永久凍土中保存了大約 14,300 年，從 5,300 年的歷史開始木乃伊人類冰人.

古代狼沒有明確的分類等級，但它的家族一直活到今天，這意味著袋狼是第一個真正滅絕的動物，其RNA被恢復(fù)。

它的一些RNA顯示出損壞的跡象，當(dāng)保存數(shù)百或數(shù)千年或使用防腐化學(xué)品時，這是可以預(yù)期的。

這些樣本也受到人類和可能的細(xì)菌RNA的污染，但研究人員能夠通過將它們與袋狼RNA序列相匹配來確認(rèn)袋狼RNA序列的真實性。物種的基因組.

在肌肉樣本中，他們發(fā)現(xiàn)了編碼組織特異性蛋白質(zhì)的RNA，包括titin和actin，它們允許肌肉纖維伸展和收縮，而在皮膚中，RNA編碼一種叫做角蛋白的結(jié)構(gòu)蛋白。

“轉(zhuǎn)錄譜與現(xiàn)存物種的轉(zhuǎn)錄圖非常相似，揭示了特定的解剖學(xué)特征，例如[骨骼肌樣本中的]慢肌纖維或血液浸潤，”Mármol-Sánchez及其同事寫.

研究小組對他們的發(fā)現(xiàn)感到興奮，他們希望這將有助于正在進(jìn)行的努力復(fù)活袋狼，一個籌集了許多資金的項目倫理和技術(shù)問題.

但更重要的是，對滅絕物種的RNA進(jìn)行測序可以為研究人員提供檢測不同RNA存在的機(jī)會。病毒隨著時間的推移，這可能會加速我們對病毒進(jìn)化的理解。

“它們在如此古老的遺骸中的存在表明，有可能從博物館干藏品中儲存的現(xiàn)存和滅絕物種的標(biāo)本中分析RNA病毒組，”Mármol-Sánchez及其同事寫.

盡管這些調(diào)查對科學(xué)家來說可能很有趣，但另一個有效的問題是，來自澳大利亞前哨島嶼的袋狼標(biāo)本是如何最終進(jìn)入瑞典博物館的，距離它曾經(jīng)居住的地方有半個地球。

該研究已發(fā)表在基因組研究.

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