哪張照片是假的?DNA現(xiàn)在可以“描繪”我們幾乎無法分辨的逼真圖像

長(zhǎng)期以來,用熒光標(biāo)記物“繪畫”一直是檢測(cè)DNA中獨(dú)特雙鏈結(jié)構(gòu)的便捷方法。曾經(jīng)僅限于只有256種顏色的調(diào)色板,科學(xué)家們現(xiàn)在可以創(chuàng)造出令人驚嘆的實(shí)驗(yàn)室藝術(shù)作品,擁有令人難以置信的1600萬種色調(diào)和色調(diào)。

新技術(shù)準(zhǔn)確地再現(xiàn)了具有24位色深的數(shù)字圖像,結(jié)果令人嘆為觀止。

這是一張?jiān)紨?shù)字圖像:

(凱基奇和利塔爾,美國(guó)化學(xué)學(xué)會(huì)雜志,2023)

還有DNA“繪制”版本:

((凱基奇和利塔爾,美國(guó)化學(xué)學(xué)會(huì)雜志,2023)

這不僅僅是一種新的藝術(shù)形式?;贒NA的小型化涂裝方法是用于研究基因表達(dá)的微陣列技術(shù)的放大,并且還有其他潛力。

研究人員經(jīng)常使用藝術(shù)作品來測(cè)試或展示技術(shù),這些技術(shù)以后可能會(huì)在實(shí)際應(yīng)用中證明是有用的。

“除了成像之外,DNA顏色代碼還可以在以下方面具有非常有用的應(yīng)用DNA上的數(shù)據(jù)存儲(chǔ),"維也納大學(xué)的化學(xué)家Tadija Keki?。

將數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為存儲(chǔ)在芯片上的DNA序列類似于將信息存儲(chǔ)在條形碼中。Keki?和另一位維也納大學(xué)化學(xué)家Jory Lietard的這種新方法可以在較小的表面上進(jìn)行更多的存儲(chǔ)。

他們的技術(shù)非常精確,可用于將微米級(jí)的特征繪制到生物聚合物上。可能的用途包括生物傳感器和診斷,其中對(duì)DNA自組裝的微調(diào)控制至關(guān)重要。

大量的信息可以作為由四個(gè)序列組成的代碼存儲(chǔ)在DNA中化學(xué)堿– 腺嘌呤、鳥嘌呤、胞嘧啶和胸腺嘧啶。每個(gè)堿基還對(duì)應(yīng)于一個(gè)伙伴,以雙鏈的形式形成互補(bǔ)序列。

手頭有一個(gè)序列為科學(xué)家提供了一種工具,可以在混亂的混亂中找到匹配的伴侶?;贒NA序列以網(wǎng)格圖案粘附在固體表面上的分析技術(shù),稱為脫氧核糖核酸微陣列,依靠彩色熒光標(biāo)記來顯示互補(bǔ)的DNA鏈何時(shí)結(jié)合在一起。

互補(bǔ)DNA鏈相互識(shí)別并結(jié)合為雙鏈的過程被稱為雜交.生物體使用簡(jiǎn)單、穩(wěn)定的雜交規(guī)則來讀取和復(fù)制它們的遺傳信息。

描繪DNA“繪畫”過程的圖形。(凱基奇和利塔爾,美國(guó)化學(xué)學(xué)會(huì)雜志,2023)

為了可視化我們?nèi)绾螌晒釪NA序列轉(zhuǎn)化為充滿活力的藝術(shù)品,描繪現(xiàn)代彩色顯示器(如手機(jī)和筆記本電腦顯示器)創(chuàng)造各種顏色的方式可能會(huì)有所幫助。

屏幕網(wǎng)格中每個(gè)像素的顏色由紅色、綠色和藍(lán)色主通道組成,每個(gè)通道的強(qiáng)度可以調(diào)高或調(diào)低以產(chǎn)生您看到的顏色。

雙鏈上堿基之間的錯(cuò)配基本上增加了其雜交的少量不穩(wěn)定性,從而改變了雙鏈DNA的分子結(jié)構(gòu)。

這種新的熒光雜交技術(shù)背后的研究人員將不穩(wěn)定性編程到鏈中,以改變其熒光標(biāo)記的亮度。通過使用不同的染料來表示不同的顏色并去除堿基,在圖案化的DNA表面上進(jìn)行雜交可以產(chǎn)生非常容易看到的圖案。

DNA片段上的特定染料(Cy3,Cy5和熒光素),稱為探針,在每個(gè)紅色、綠色和藍(lán)色通道中創(chuàng)建 256 種色調(diào)的光線。這在無色和全色之間產(chǎn)生類似滑塊的熒光信號(hào)。

“從本質(zhì)上講,我們的合成表面變成了用微米級(jí)的DNA分子繪畫的畫布,”利塔德。

腳本將數(shù)字圖像分成三個(gè)顏色通道(RGB),在每個(gè)通道中,為每個(gè)像素的強(qiáng)度值分配一個(gè)DNA序列。第二個(gè)腳本合并這些序列以進(jìn)行DNA合成。熒光探針 - 每個(gè)對(duì)應(yīng)于三個(gè)顏色通道 - 進(jìn)行雜交,并被掃描和合并以揭示DNA“繪畫”。(凱基奇和利塔爾,美國(guó)化學(xué)學(xué)會(huì)雜志,2023)

為了演示顏色范圍,該團(tuán)隊(duì)將數(shù)字圖像分成三個(gè)8位RGB層,并為每個(gè)像素的值分配DNA序列。在指甲蓋大小的微陣列上,該技術(shù) – 無掩模陣列合成與光刻– 可以一次合成數(shù)十萬個(gè)獨(dú)特的DNA序列。

具有數(shù)十萬個(gè)小鏡子的設(shè)備對(duì)應(yīng)于圖像中的像素和計(jì)算機(jī)腳本,超過786,000個(gè)DNA序列可以以網(wǎng)格形式安裝在微陣列表面上。RGB層中每個(gè)14 x 14微米的像素單位都有一個(gè),并在DNA片段中編碼有關(guān)強(qiáng)度值的信息。

掃描三個(gè)微小的微陣列,或精確排列的“DNA畫布”,然后將這些層以數(shù)字方式合并在一起,可以以1024 x 768像素的分辨率以超過1600萬種顏色再現(xiàn)原始圖像。該團(tuán)隊(duì)認(rèn)為這個(gè)過程可以擴(kuò)展到全高清甚至4K。

“通過使用簡(jiǎn)單的過程,可以在微米級(jí)以高保真度再現(xiàn)數(shù)字圖像,”作者說。.

在許多用途中,更高分辨率的熒光信號(hào)可以更精確地測(cè)量我們體內(nèi)發(fā)生的過程,從而更好地了解細(xì)胞生物學(xué),并更早地檢測(cè)疾病,例如癌癥.

該研究已發(fā)表在美國(guó)化學(xué)學(xué)會(huì)雜志.

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